Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Calr3Q9D9Q6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Calr3Q9D9Q6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Calr3Q9D9Q6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr3Q9D9Q6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr3Q9D9Q6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calr3Q9D9Q6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calr3Q9D9Q6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calr3Q9D9Q6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calr3Q9D9Q6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calr3Q9D9Q6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calr3Q9D9Q6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calr3Q9D9Q6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calr3Q9D9Q6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Calr3Q9D9Q6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr3Q9D9Q6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms