Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D8Q6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9D8Q6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D8Q6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms