Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D7E4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D7E4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D7E4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D7E4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D7E4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D7E4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D7E4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D7E4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D7E4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D7E4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D7E4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D7E4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms