Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb4aQ9D6F9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubb4aQ9D6F9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubb4aQ9D6F9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubb4aQ9D6F9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb4aQ9D6F9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms