Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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