Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt34Q9D646 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt34Q9D646 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt34Q9D646 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt34Q9D646 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Krt34Q9D646 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt34Q9D646 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt34Q9D646 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt34Q9D646 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt34Q9D646 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt34Q9D646 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt34Q9D646 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt34Q9D646 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt34Q9D646 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt34Q9D646 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt34Q9D646 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt34Q9D646 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt34Q9D646 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt34Q9D646 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt34Q9D646 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt34Q9D646 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms