Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp6v1e2Q9D593 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp6v1e2Q9D593 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp6v1e2Q9D593 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp6v1e2Q9D593 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp6v1e2Q9D593 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp6v1e2Q9D593 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp6v1e2Q9D593 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp6v1e2Q9D593 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp6v1e2Q9D593 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp6v1e2Q9D593 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp6v1e2Q9D593 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp6v1e2Q9D593 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp6v1e2Q9D593 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp6v1e2Q9D593 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms