Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc7Q9D541 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc7Q9D541 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc7Q9D541 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc7Q9D541 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc7Q9D541 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc7Q9D541 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc7Q9D541 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc7Q9D541 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc7Q9D541 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc7Q9D541 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc7Q9D541 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc7Q9D541 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc7Q9D541 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc7Q9D541 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc7Q9D541 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc7Q9D541 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc7Q9D541 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc7Q9D541 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc7Q9D541 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc7Q9D541 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc7Q9D541 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc7Q9D541 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc7Q9D541 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc7Q9D541 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc7Q9D541 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc7Q9D541 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc7Q9D541 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc7Q9D541 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc7Q9D541 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc7Q9D541 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc7Q9D541 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms