Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc130Q9D516 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc130Q9D516 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc130Q9D516 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc130Q9D516 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc130Q9D516 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc130Q9D516 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc130Q9D516 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc130Q9D516 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc130Q9D516 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc130Q9D516 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc130Q9D516 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc130Q9D516 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms