Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc2Q9D4Q1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ribc2Q9D4Q1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc2Q9D4Q1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc2Q9D4Q1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ribc2Q9D4Q1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ribc2Q9D4Q1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ribc2Q9D4Q1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ribc2Q9D4Q1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ribc2Q9D4Q1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ribc2Q9D4Q1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ribc2Q9D4Q1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ribc2Q9D4Q1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc2Q9D4Q1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ribc2Q9D4Q1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ribc2Q9D4Q1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ribc2Q9D4Q1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ribc2Q9D4Q1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ribc2Q9D4Q1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ribc2Q9D4Q1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ribc2Q9D4Q1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ribc2Q9D4Q1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ribc2Q9D4Q1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms