Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Odf2lQ9D478 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Odf2lQ9D478 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Odf2lQ9D478 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Odf2lQ9D478 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Odf2lQ9D478 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Odf2lQ9D478 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Odf2lQ9D478 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Odf2lQ9D478 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Odf2lQ9D478 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Odf2lQ9D478 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Odf2lQ9D478 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Odf2lQ9D478 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Odf2lQ9D478 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Odf2lQ9D478 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Odf2lQ9D478 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Odf2lQ9D478 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Odf2lQ9D478 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Odf2lQ9D478 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Odf2lQ9D478 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Odf2lQ9D478 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Odf2lQ9D478 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Odf2lQ9D478 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Odf2lQ9D478 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Odf2lQ9D478 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Odf2lQ9D478 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms