Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Katnal2Q9D3R6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Katnal2Q9D3R6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Katnal2Q9D3R6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Katnal2Q9D3R6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms