Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G9

Rhoh, Rho-related GTP-binding protein RhoH, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhohQ9D3G9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhohQ9D3G9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhohQ9D3G9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhohQ9D3G9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhohQ9D3G9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhohQ9D3G9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms