Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdhd3Q9CYW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hdhd3Q9CYW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hdhd3Q9CYW4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdhd3Q9CYW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdhd3Q9CYW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.8 ms