Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx7Q9CY18 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx7Q9CY18 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx7Q9CY18 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx7Q9CY18 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms