Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lhfpl3Q9CTN8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms