Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700029F12RikQ9CRB4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700029F12RikQ9CRB4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700029F12RikQ9CRB4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029F12RikQ9CRB4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms