Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd1Q9CR42 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ankrd1Q9CR42 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ankrd1Q9CR42 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ankrd1Q9CR42 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ankrd1Q9CR42 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ankrd1Q9CR42 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms