Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ykt6Q9CQW1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ykt6Q9CQW1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ykt6Q9CQW1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ykt6Q9CQW1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ykt6Q9CQW1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ykt6Q9CQW1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ykt6Q9CQW1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ykt6Q9CQW1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ykt6Q9CQW1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms