Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS2

Nop10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop10Q9CQS2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nop10Q9CQS2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop10Q9CQS2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nop10Q9CQS2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nop10Q9CQS2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nop10Q9CQS2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms