Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc2Q9CQP2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc2Q9CQP2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc2Q9CQP2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc2Q9CQP2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms