Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl41Q9CQN7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl41Q9CQN7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl41Q9CQN7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl41Q9CQN7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl41Q9CQN7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl41Q9CQN7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl41Q9CQN7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl41Q9CQN7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl41Q9CQN7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl41Q9CQN7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl41Q9CQN7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl41Q9CQN7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms