Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN1

Trap1, Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1Q9CQN1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1Q9CQN1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trap1Q9CQN1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trap1Q9CQN1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trap1Q9CQN1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trap1Q9CQN1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms