Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Txndc17Q9CQM5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Txndc17Q9CQM5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Txndc17Q9CQM5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Txndc17Q9CQM5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Txndc17Q9CQM5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms