Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl39lQ9CQD0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl39lQ9CQD0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rpl39lQ9CQD0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rpl39lQ9CQD0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rpl39lQ9CQD0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl39lQ9CQD0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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