Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SdhbQ9CQA3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SdhbQ9CQA3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SdhbQ9CQA3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SdhbQ9CQA3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SdhbQ9CQA3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SdhbQ9CQA3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SdhbQ9CQA3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SdhbQ9CQA3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SdhbQ9CQA3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SdhbQ9CQA3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SdhbQ9CQA3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SdhbQ9CQA3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SdhbQ9CQA3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SdhbQ9CQA3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SdhbQ9CQA3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdhbQ9CQA3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdhbQ9CQA3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SdhbQ9CQA3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SdhbQ9CQA3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SdhbQ9CQA3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SdhbQ9CQA3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SdhbQ9CQA3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SdhbQ9CQA3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SdhbQ9CQA3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SdhbQ9CQA3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 898.6 ms