Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ85

Timm22, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm22Q9CQ85 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timm22Q9CQ85 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Timm22Q9CQ85 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm22Q9CQ85 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timm22Q9CQ85 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Timm22Q9CQ85 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms