Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN4RQ9BZR6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTN4RQ9BZR6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTN4RQ9BZR6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4RQ9BZR6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms