Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NSD3Q9BZ95 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NSD3Q9BZ95 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NSD3Q9BZ95 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NSD3Q9BZ95 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NSD3Q9BZ95 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NSD3Q9BZ95 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NSD3Q9BZ95 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NSD3Q9BZ95 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
NSD3Q9BZ95 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NSD3Q9BZ95 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NSD3Q9BZ95 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NSD3Q9BZ95 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NSD3Q9BZ95 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NSD3Q9BZ95 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NSD3Q9BZ95 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NSD3Q9BZ95 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NSD3Q9BZ95 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NSD3Q9BZ95 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NSD3Q9BZ95 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NSD3Q9BZ95 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NSD3Q9BZ95 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NSD3Q9BZ95 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NSD3Q9BZ95 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NSD3Q9BZ95 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NSD3Q9BZ95 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NSD3Q9BZ95 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NSD3Q9BZ95 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NSD3Q9BZ95 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NSD3Q9BZ95 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms