Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A8Q9BY19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A8Q9BY19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A8Q9BY19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A8Q9BY19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A8Q9BY19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A8Q9BY19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A8Q9BY19 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MS4A8Q9BY19 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A8Q9BY19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A8Q9BY19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A8Q9BY19 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms