Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RSPO3Q9BXY4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RSPO3Q9BXY4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RSPO3Q9BXY4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RSPO3Q9BXY4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms