Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG6Q9BXT2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG6Q9BXT2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG6Q9BXT2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms