Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1QTNF4Q9BXJ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1QTNF4Q9BXJ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1QTNF4Q9BXJ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1QTNF4Q9BXJ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1QTNF4Q9BXJ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1QTNF4Q9BXJ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1QTNF4Q9BXJ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C1QTNF4Q9BXJ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1QTNF4Q9BXJ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C1QTNF4Q9BXJ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms