Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW61

DDA1, DET1- and DDB1-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDA1Q9BW61 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDA1Q9BW61 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDA1Q9BW61 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDA1Q9BW61 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDA1Q9BW61 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDA1Q9BW61 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDA1Q9BW61 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDA1Q9BW61 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDA1Q9BW61 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDA1Q9BW61 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDA1Q9BW61 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDA1Q9BW61 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDA1Q9BW61 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDA1Q9BW61 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDA1Q9BW61 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDA1Q9BW61 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms