Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHANK2-AS3Q9BTD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms