Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS3Q9BRX5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GINS3Q9BRX5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS3Q9BRX5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms