Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM2D3Q9BRN9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM2D3Q9BRN9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM2D3Q9BRN9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms