Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MESP1Q9BRJ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MESP1Q9BRJ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MESP1Q9BRJ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MESP1Q9BRJ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.4 ms