Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS25Q9BRG1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS25Q9BRG1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VPS25Q9BRG1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.5 ms