Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF559Q9BR84 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF559Q9BR84 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF559Q9BR84 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF559Q9BR84 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms