Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTP3Q9BQQ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTP3Q9BQQ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTP3Q9BQQ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTP3Q9BQQ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTP3Q9BQQ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTP3Q9BQQ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms