Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C19orf43Q9BQ61 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C19orf43Q9BQ61 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C19orf43Q9BQ61 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C19orf43Q9BQ61 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C19orf43Q9BQ61 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms