Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim3Q99PE5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smim3Q99PE5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim3Q99PE5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim3Q99PE5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms