Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Rims1Q99NE5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rims1Q99NE5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rims1Q99NE5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rims1Q99NE5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rims1Q99NE5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rims1Q99NE5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rims1Q99NE5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rims1Q99NE5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rims1Q99NE5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rims1Q99NE5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rims1Q99NE5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rims1Q99NE5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rims1Q99NE5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rims1Q99NE5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rims1Q99NE5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rims1Q99NE5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rims1Q99NE5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rims1Q99NE5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rims1Q99NE5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rims1Q99NE5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rims1Q99NE5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rims1Q99NE5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rims1Q99NE5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rims1Q99NE5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rims1Q99NE5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rims1Q99NE5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Rims1Q99NE5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rims1Q99NE5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Rims1Q99NE5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rims1Q99NE5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rims1Q99NE5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Rims1Q99NE5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rims1Q99NE5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rims1Q99NE5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rims1Q99NE5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rims1Q99NE5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rims1Q99NE5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms