Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cstf3Q99LI7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cstf3Q99LI7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cstf3Q99LI7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cstf3Q99LI7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms