Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lims1Q99JW4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lims1Q99JW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lims1Q99JW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lims1Q99JW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms