Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3GL3Q99963 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3GL3Q99963 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3GL3Q99963 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms