Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRTNQ99748 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRTNQ99748 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRTNQ99748 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRTNQ99748 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRTNQ99748 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRTNQ99748 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRTNQ99748 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRTNQ99748 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRTNQ99748 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRTNQ99748 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRTNQ99748 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRTNQ99748 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRTNQ99748 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRTNQ99748 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRTNQ99748 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms