Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTRQ99707 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MTRQ99707 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MTRQ99707 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTRQ99707 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTRQ99707 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTRQ99707 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTRQ99707 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MTRQ99707 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MTRQ99707 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MTRQ99707 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTRQ99707 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTRQ99707 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTRQ99707 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTRQ99707 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTRQ99707 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTRQ99707 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTRQ99707 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MTRQ99707 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTRQ99707 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTRQ99707 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTRQ99707 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTRQ99707 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTRQ99707 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTRQ99707 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTRQ99707 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTRQ99707 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTRQ99707 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTRQ99707 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTRQ99707 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTRQ99707 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTRQ99707 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTRQ99707 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTRQ99707 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTRQ99707 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTRQ99707 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTRQ99707 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTRQ99707 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTRQ99707 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTRQ99707 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTRQ99707 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTRQ99707 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTRQ99707 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTRQ99707 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTRQ99707 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTRQ99707 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MTRQ99707 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MTRQ99707 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MTRQ99707 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MTRQ99707 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTRQ99707 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTRQ99707 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTRQ99707 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTRQ99707 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTRQ99707 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTRQ99707 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTRQ99707 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTRQ99707 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTRQ99707 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MTRQ99707 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MTRQ99707 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
MTRQ99707 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MTRQ99707 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MTRQ99707 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTRQ99707 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTRQ99707 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTRQ99707 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTRQ99707 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MTRQ99707 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MTRQ99707 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTRQ99707 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTRQ99707 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTRQ99707 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTRQ99707 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTRQ99707 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTRQ99707 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTRQ99707 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTRQ99707 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MTRQ99707 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTRQ99707 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTRQ99707 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTRQ99707 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTRQ99707 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTRQ99707 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MTRQ99707 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTRQ99707 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTRQ99707 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTRQ99707 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTRQ99707 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTRQ99707 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTRQ99707 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTRQ99707 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTRQ99707 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTRQ99707 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTRQ99707 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTRQ99707 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTRQ99707 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTRQ99707 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MTRQ99707 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTRQ99707 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms