Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATXN2Q99700 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN2Q99700 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN2Q99700 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN2Q99700 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms